2008年12月22日，国务院正式批准海口保税区区位调整至海南澄迈县老城经济开发区，设立海口综合保税区，规划面积1.93平方公里。这是继天津滨海新区、江苏苏州工业园区、北京天竺之后的我国第4个综合保税区。海口市人民政府在海口举行了新闻发布会。
海口保税区自1994年建成后，一度发挥了积极的作用，但随着海口经济的快速发展，原有保税区的功能已不适应海口外向经济发展的需要，客观上需要转型，如何进一步改革保税区的管理体制，更好地发挥保税区的优势，成为一个紧迫的问题。这次国务院批准海口保税区转型为综合保税区，将原海口保税区移位到拥有马村港优势的澄迈老城经济开发区，必将对海南产业结构上的调整产生极大的作用，有助于推动海南外向型经济和现代物流产业的发展，也有利于加快环北部湾经济圈的发展及扩大与东盟自由贸易的交流与合作等。
